项目名称: 应用基因组集结信息建立复杂性状基因精确定位的新方法
项目编号: No.30972092
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2010
项目学科: 生物科学
项目作者: 刘剑锋
作者单位: 中国农业大学
项目金额: 31万元
中文摘要: 寻找和检测控制复杂性状基因历来是畜禽分子育种研究的重要研究课题。当前普遍采用两种基因定位策略:(1)连锁和连锁不平衡分析;(2)基于高密度SNP标记的基因/性状关联分析。其主要不足在于:仅仅利用单一遗传标记基因型信息,检测结果缺乏生物学意义解释,定位精度和准确性低。本研究采用基因组集结信息的分析思想,建立复杂性状基因精确定位的新策略和相应统计方法。所建立的新方法不但利用遗传标记基因型信息,还能够同时整合基因组位置信息、进化信息、连锁信息、基因调控网络信息,从而在基因组整体水平上解析复杂性状遗传机制,为基因定位结果提供更为确凿的生物学证据和科学解释。本研究旨在克服现有定位方法的普遍问题,所建立的基因定位新方法将利用计算机模拟研究和现有的实际试验数据分析进行性能检验,在此基础上进一步建立适用于实际基因定位试验数据处理的通用算法,以取得基因定位理论和方法的突破。
中文关键词: 基因组信息;复杂性状;基因组注释系统;全基因组关联分析;拷贝数变异
英文摘要:
英文关键词: genomic information;complex traits;Snat;GWAS;CNV