项目名称: 考虑基因与环境互作的基因组育种值估计新方法
项目编号: No.31371258
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2013
项目学科: 生物科学
项目作者: 王重龙
作者单位: 安徽省农业科学院
项目金额: 80万元
中文摘要: 畜禽的生产性状通常是复杂性状,同时受到基因、环境以及基因与环境(G×E)互作共同的影响。若不考虑G×E互作效应,估计的育种值(EBV)会有偏差。基因组育种值(GEBV)估计方法是实施基因组选择(GS)的一个核心部分。目前GEBV估计方法未能考虑G×E互作,但GS中参考群和验证群往往处于不同的环境,G×E互作对GEBV估计的影响更大。因此,本研究拟将目前常规GEBV估计方法(直接、间接方法)和传统G×E互作分析主流方法(Reaction norm model)相结合,提出考虑G×E互作的GEBV估计新方法,进行新方法的理论推导,编程实现该方法,开展模拟试验及实际数据验证,不断修正、优化新方法及程序,与其他方法比较。同时,开发考虑G×E互作的基因组数据模拟程序,为模拟试验提供数据支持。本项目的实施对填补国内外该方面空白、丰富GS理论体系、推动GS在畜禽育种中的应用具有重要的理论和实际意义。
中文关键词: 基因组选择;基因与环境互作;贝叶斯方法;BLUP方法;基因组数据模拟
英文摘要: Livestock production traits are usually complex traits controled by genes, environment, genotype × environment (G× E) interactions. EBVs are not accurate if G× E interactions are not included in the model. The methods of GEBV estimation are the core of ge
英文关键词: Genomic selection;G × E interaction;Bayesian approach;BLUP method;Genomic data simulation