项目名称: 蛋白质骨架中无规则回路(loops)结构的理论研究及在酶分子改造中的应用
项目编号: No.31370716
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2013
项目学科: 生物科学
项目作者: 杜奇石
作者单位: 广西科学院
项目金额: 70万元
中文摘要: 无规则回路(loops)与α-螺旋、β-折叠并列,是蛋白质3D结构的二级结构单元。在蛋白质中47%的氨基酸残基在loop结构中,loops是蛋白质结构中最复杂和最活跃的部分,对蛋白质的稳定性、柔韧性和动态活性起重要作用。许多酶分子的催化活性中心氨基酸和药物靶标蛋白的配体结合位点都在loops上,loops往往是酶分子生物技术改造的主要对象。然而至今仍然不清楚是什么分子间作用力支撑着loop的结构。预研发现,一种研究尚不充分的分子间作用力极性氢-π键在蛋白质折叠中起特殊作用,是loops的主要支撑力。按极性氢-π键的类型二肽折叠分为四种基本构型。计划进一步研究极性氢-π键在蛋白质结构和折叠中的作用,根据极性氢-π键的概念探讨loop的结构类型和蛋白质基本构件(protein blocks),发展loop折叠能的快速计算方法,解释蛋白质中loop的结构与功能的关系,预测和指导酶分子改造实验。
中文关键词: 蛋白质结构;蛋白质折叠;肽链骨架;蛋白质无规则结构;蛋白质工程
英文摘要: The irregular loops, α-helixes, β-strands are the three secondary structural units of protein structures. In proteins aroud 47% residues are located in the loops, and the loops are the most active motifs in proteins, responsible for the stabilty, flexibil
英文关键词: Protein structure;Protein folding;Peptide backbone;Protein irregular structure;Protein engineering