棉花基因组结构与功能的比较基因组学研究

项目名称： 棉花基因组结构与功能的比较基因组学研究

项目编号： No.31371282

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 生物科学

项目作者： 王希胤

作者单位： 河北联合大学

项目金额： 70万元

中文摘要： 棉花是人类最重要的纤维作物，刚刚完成的棉花D基因组测序，为研究和改良棉花性状提供了资源。因此对D基因组的深入分析具有重要的科学意义和潜在的经济价值。然而棉花复杂的基因组特征影响了对其结构和多倍化发生规模的深层次研究，以致两个棉花基因组测序小组得到了完全不同的结论。我们认为这主要是因为缺乏分析复杂基因组的方法和软件。本项目旨在以棉花基因组分析为核心，开发新的解析复杂基因组的方法和软件，用于解析棉花基因组的结构，重建多倍化过程中多个子基因组的构成，确定多倍化事件后基因组发生的主要重排事件，重构进化过程中多个节点的祖先基因组的主要构成，生成多个相关基因组的联合比对，同时基于系统发育和进化理论的分析，探索与棉花发育相关的多个重要基因、基因家族和调控路径功能的进化规律。项目研究成果将有力支持棉花其它相关领域研究，并为解析其它复杂基因组提供方法和工具。

中文关键词： 棉花；基因组学；多倍化；进化分析；染色体

英文摘要： Being the most important fiber plant, cotton has just been sequenced its D genome sequence. However, the complexity in its genome composition has restricted to perform a comprehensive analysis, especially about the scale of polyploidization, which two seq

英文关键词： Cotton；Genomics；Polyploid；Evolutionary analysis；Chromosome