项目名称: 中国MRSA的比较和进化基因组学研究
项目编号: No.30971571
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2010
项目学科: 生物科学
项目作者: 王辉
作者单位: 北京大学
项目金额: 30万元
中文摘要: "超级细菌"甲氧西林耐药的金黄色葡萄球菌(MRSA)已成为医院和社区感染的最重要的多重耐药菌。据前期研究结果,我们选取近15年不同来源、不同克隆型的108株金葡菌(包括MSSA、HA-MRSA、CA-MRSA、hVISA/VISA、动物源和国际克隆株),采用已构建的金葡菌DNA芯片进行比较基因学研究,比较基因岛、致病性岛(SaPIs)、噬菌体、质粒和转座子等携带的毒素基因、耐药基因、粘附蛋白基因、调控基因的异同,发掘MRSA不同克隆的特异基因及差异区域,结合大规模位点特异性PCR,明确基因获得或者缺失在MRSA微进化中的作用,探索成功的流行克隆t030、t002的生存优势,勾勒MRSA基因组进化的概略图;采用spa、MLST分析关键基因位点的遗传多态性,研究金葡菌的系统发育,构建系统进化树,确定其种群结构。通过此研究从全基因组水平阐明MRSA微进化规律,为MRSA的追踪溯源提供遗传学依据。
中文关键词: 金黄色葡萄球菌;比较基因组芯片;全基因组测序;进化;
英文摘要:
英文关键词: Staphylococcus aureus;comparative genomic microarray;whole genomic sequencing;evolution;