基于转录组水平的microRNA对外界环境扰动拮抗效应研究

项目名称： 基于转录组水平的microRNA对外界环境扰动拮抗效应研究

项目编号： No.31401120

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 生物科学

项目作者： 杨桢

作者单位： 中国科学院上海生命科学研究院

项目金额： 24万元

中文摘要： microRNA（miRNA）是一类长度约为22个核苷酸的内源性非编码RNA分子，可通过干扰mRNA指导蛋白合成过程，在转录后水平上发挥基因表达调控作用。为深入了解miRNA通过调节其靶基因表达波动，从而拮抗外界环境因素刺激中的作用，本研究拟筛选多套不同环境因素影响下的全基因组表达谱数据，通过一种改进后的meta-分析方法对具有不同表达波动程度的基因进行深入挖掘，用以比较miRNA靶基因与非靶基因之间的表达波动程度差异，从而明确miRNA对靶基因表达波动的调节作用。随后对具有不同波动程度基因的miRNA调控数量、单核苷酸多态位点数量，以及3’-非翻译区长度进行比较，对miRNA与靶基因表达波动进行关联分析，明确miRNA对其靶基因表达波动性起关键调节作用的因素。本研究从整体上分析miRNA对其靶基因表达波动的作用规律，对深入了解miRNA在拮抗环境扰动背后的内在机制将具有重要意义。

中文关键词： microRNA；环境扰动；表达波动；转录因子；调控网络

英文摘要： microRNAs (miRNAs) are a class of endogenously expressed small noncoding RNAs of 22 nt in length, they can regulate the target gene expression at the post-transcriptional level by interfering the translational process of mRNAs. For systematically analyze

英文关键词： microRNA；environment pertubation；expression variation；transcription factor；regulatory network