大肠癌组织样本的蛋白质组学和转录组学整合研究

项目名称： 大肠癌组织样本的蛋白质组学和转录组学整合研究

项目编号： No.30901731

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 生物科学

项目作者： 余捷凯

作者单位： 浙江大学

项目金额： 20万元

中文摘要： 目前从转录组和蛋白质组的角度研究大肠癌肿瘤相关标志物已有较多成果，但基因表达谱和蛋白质组的整合分析将更有利于大肠癌肿瘤发生发展相关的基因及其蛋白质的筛选。本研究在原有工作基础上拟进行(1)对大肠癌和癌旁冰冻组织激光显微切割获取大肠癌细胞和正常腺体对照细胞 (2)提取总RNA，利用基于新一代Solexa高通量测序法的数字基因表达技术检测mRNA样本，确定基因转录数量，并筛选出差异表达基因。(3)裂解提总蛋白，溶液内酶解，用氧同位素标记。多维纳升级液相分离结合LTQ Orbitrap质谱检测样本，确定差异表达蛋白。(4) 运用生物信息学对转录组和蛋白质组整合分析，筛选在转录组水平和蛋白水平均表达差异的基因。(5)用Western Blot及定量PCR法进一步验证这几个标志物的表达。筛选出新的大肠癌发生发展相关靶标志物，为大肠癌的诊治提供研究基础

中文关键词： ITIH4基因；蛋白质表达；基因表达；生物信息学整合分析；质谱

英文摘要：

英文关键词： ITIH4；gene expression；protein expression；bioinformatics；MS