项目名称: 基于多尺度调控特性的癌症microRNA调控网络的建模与分析

项目编号: No.61370035

项目类型: 面上项目

立项/批准年度: 2013

项目学科: 自动化技术、计算机技术

项目作者: 古槿

作者单位: 清华大学

项目金额: 80万元

中文摘要: microRNA(简称miRNA)是一类重要的调控小RNA。异常的miRNA调控网络与癌症发生发展的各个阶段均有密切关系。在癌症里发生异常调控的miRNA被称为“癌症microRNA”(onco-microRNA,简称oncomiR),并与其异常调控的靶基因组成oncomiR调控网络。目前,已知调控机制的oncomiR较少,其调控网络的数学模型仍不明确。我们的研究结果以及相关生物学实验证据均表明miRNA调控呈现多尺度的特性:有的miRNA有数百甚至上千个靶基因,广泛调控各种生物过程;而有的仅有几十个靶基因,特异性调控个别生物过程。而癌症这类复杂疾病也涉及到大量的、不同尺度的生物过程的异常调控。因此,为了开展oncomiR调控的系统研究,我们计划首先建立基于多尺度调控特性的oncomiR调控网络的数学模型,然后结合大规模癌症临床样本的表达数据对oncomiR调控网络进行系统的识别与分析。

中文关键词: microRNA;cancer;integrative analysis;network inference;

英文摘要: MicroRNAs (miRNAs) are a class of important regulatory small RNAs. The dys-regulations of miRNA regulatory networks are closely associated with multiple stages of cancer initiation and progression. The dys-regulated miRNAs in cancer are usually called as

英文关键词: microRNA;癌症;整合分析;网络推断;

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