天然无序蛋白质的结合动力学特性及序列－结构关系

项目名称： 天然无序蛋白质的结合动力学特性及序列－结构关系

项目编号： No.20973016

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 数理科学和化学

项目作者： 刘志荣

作者单位： 北京大学

项目金额： 28万元

中文摘要： 天然无序蛋白质是近年来发现的一类特殊的蛋白质，它们在生物体内广泛存在，虽然没有特定的三维结构，但却具有正常的生物学功能，参与了细胞中很多重要的生理与病理过程。对天然无序蛋白质的研究，不但有助于揭示蛋白质结构和功能关系的本质，而且可以对很多疾病的治疗提供新的思路。本项目将通过理论分析与计算机模拟的手段研究天然无序蛋白质的结合动力学特性及序列结构关系：利用分子动力学方法模拟pKID蛋白与KIX蛋白的结合及诱导折叠过程，分析无序蛋白质在结合过程中所具有的动力学优势；计算在稳定性保持恒定的情况下无序蛋白质与其它生物大分子结合时的反应势垒，并调查这种反应势垒的微观来源；研究氨基酸性质（电荷、疏水性、尺寸等）对蛋白质有序－无序结构的影响。通过揭示无序蛋白质结合动力学特性的微观来源，为相关的实验研究及应用提供观念上的借鉴与参考。

中文关键词： 天然无序蛋白质；蛋白质折叠；蛋白质－蛋白质相互作用；三维结构域交换；分子模拟

英文摘要：

英文关键词： Intrinsically Disordered Prote；protein folding；protein-protein interaction；three-dimensional domain swapp；molecular simulation