瓯江彩鲤体色变异的转录组与DNA甲基化分析

项目名称： 瓯江彩鲤体色变异的转录组与DNA甲基化分析

项目编号： No.31372521

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 农业科学

项目作者： 王成辉

作者单位： 上海海洋大学

项目金额： 78万元

中文摘要： 体色变异的遗传调控机制是脊椎动物遗传学与进化生物学的重要研究方向。鱼类体色变异的遗传机制研究集中在斑马鱼、青鳉等模式生物，而鲤这方面的研究尚属空白。瓯江彩鲤体色丰富，是研究鱼类体色变异的良好材料。我们前期的表型遗传研究表明：黑色对红色、白色均为显性，红色对白色为显性，但其遗传调控机制尚不清楚。本申请应用第二代测序技术对不同色彩的瓯江彩鲤进行转录组和DNA甲基化分析，了解不同色彩间的基因表达差异与DNA甲基化差异，比较基因表达和表观遗传修饰之间的关系，了解甲基化调控的差异表达基因；应用Bisulfate sequencing技术对差异表达基因的甲基化位点进行验证，判断特定区域DNA甲基化修饰模式；通过DNA去甲基化处理，观察瓯江彩鲤的表观体色变异，研究特定基因甲基化与特定表型之间的关联，解析瓯江彩鲤体色变异的遗传调控机制。

中文关键词： 瓯江彩鲤；体色；转录组；甲基化组；基因敲除

英文摘要： Genetic regulation mechanism of pigmentation variation has been a major research field of genetics and evolutionary biology in vertebrates. In fish, this research topic has been focused on model fishes, such as zebrafish and medaka fish. However, no repor

英文关键词： Oujiang Color common carp；body color；transcriptome；epigenome；gene knock out