整合高通量基因、代谢子和通路结构信息的癌症风险代谢通路区域系统识别

项目名称： 整合高通量基因、代谢子和通路结构信息的癌症风险代谢通路区域系统识别

项目编号： No.31200996

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 生物科学

项目作者： 李春权

作者单位： 哈尔滨医科大学

项目金额： 22万元

中文摘要： 癌症发生、发展与代谢通路的功能异常密切相关。高通量的基因组学、代谢组学技术的涌现使生物信息学方法能够开始应用到疾病风险代谢通路区域识别，并迅速成为常规的识别疾病风险代谢通路策略。然而，现存的方法往往采用单一的统计学评价，缺乏对通路分子信息的整合和特定疾病信息的具体分析和利用。这严重限制了癌症通路区域的识别精确度和稳定性。本项目提出整合癌症基因数据、基因表达谱数据和代谢子及其浓度数据，以重构通路获得的有向图模型为整合依托，研究利用通路结构信息精细识别癌症高风险代谢通路区域的生物信息学方法。通过对癌症基因、代谢子信息和通路结构信息有效的整合、分析和利用，尝试精确定位癌症的风险通路区域。本课题将利用多种癌症和同种癌症的多套高通量数据进行通路分析，以提高预测癌症的风险通路区域的精确度和稳定性。最终构建分析平台提供识别多种癌症风险代谢通路区域的功能。本课题对阐明癌症发生、发展的通路机制具有重要意义。

中文关键词： 风险代谢通路；癌症；基因；代谢子；通路结构信息

英文摘要： The initiation and progression of cancer are closely related to functional abnormality of metabolic pathways. The high-throughput genomics and metabolomics techniques make us able to apply bioinformatics methods to disease risk metabolic pathway region id

英文关键词： risk metabolic pathway；cance；gene；metabolite；pathway structure information