基于染色质远程交互作用的长链非编码RNA（lncRNA）研究

项目名称： 基于染色质远程交互作用的长链非编码RNA（lncRNA）研究

项目编号： No.91440114

项目类型： 重大研究计划

立项/批准年度： 2014

项目学科： 生物科学

项目作者： 李国亮

作者单位： 华中农业大学

项目金额： 80万元

中文摘要： 近年来，随着RNA-Seq技术的发展，人们发现了大量的长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）。这样，研究lncRNA的功能和它们调控的目标基因成为一个重要问题。然而，目前在世界上没有合适的方法在基因组范围内进行所有lncRNA的目标基因研究。在该项目中，我们首次提出了基于染色质远程交互作用的lncRNA研究方法。利用染色质远程交互作用技术，可以检测到大量的DNA与DNA之间的交互作用。这样通过染色质远程交互作用，可以将具有顺式调控功能的lncRNA连接到它们的调控目标基因。根据这一原理，我们可以发现lncRNA的调控目标，并解释在lncRNA与mRNA共表达分析中，哪些共表达是通过lncRNA与它们目标基因的物理相互作用而发生的。在人类白血病和小鼠细胞的初步研究中，我们应用该方法，已经发现候选的关键lncRNA和它们调控的目标基因。

中文关键词： 长链非编码RNA；染色质远程相互作用；调控作用；功能验证；

英文摘要： In recent years, with the development of RNA-Seq technology, many long non-coding RNAs (lncRNAs) have been identified. Then, an important question is to study the function of lncRNAs and identify the target genes regulated by lncRNAs. However, at present

英文关键词： long non-coding RNA；long-range chromatin interaction；regulatory functio；functional validation；