项目名称: 白斑病毒感染凡纳滨对虾的高通量转录组测序及分析
项目编号: No.31160531
项目类型: 地区科学基金项目
立项/批准年度: 2012
项目学科: 畜牧学与草地科学、兽医学、水产学
项目作者: 陈晓汉
作者单位: 广西壮族自治区水产研究所
项目金额: 50万元
中文摘要: 转录组即特定组织或细胞在某一功能状态下转录出来的所有RNA的总和,Roche 454高通量测序技术一次运行可以获得上百万个读长片段,平均读长400bp以上,为转录组的测定与定量提供了快速简便的新方法。 抗病毒研究的策略之一是抑制宿主细胞中与病毒入侵或复制密切相关的蛋白功能,或者提高宿主细胞中抗病毒相关的免疫蛋白的表达。本项目拟利用Roche 454高通量测序技术,对白斑病毒感染及对照的凡纳滨对虾样品进行转录组测序,研究病毒感染及对照的凡纳滨对虾的mRNA表达谱差异,寻找病毒感染对虾差异表达基因,为筛选对虾抗病毒药物的分子靶标或研制对虾免疫增强药物提供依据,并可望发现一批凡纳滨对虾新基因,这对于我国积极参与国际上对虾基因知识产权的争夺有积极作用,转录组测序数据可供国内相关单位共享,对于加快我国的凡纳滨对虾病害防治和分子遗传育种研究进展有重要意义。
中文关键词: 凡纳滨对虾;白斑综合症病毒;转录组;高通量测序;
英文摘要:
英文关键词: Litopenaeus vannamei;White spot syndrome virus;Transcriptome;High-throughput sequencing;