前沿!生物数据挖掘中的深度学习综述论文,36页pdf,诺丁汉特伦特大学

2020 年 3 月 5 日 专知


https://arxiv.org/abs/2003.00108


最近数据采集工具的技术进步使生命科学家能够从不同的生物应用领域获取多模式数据。大致分为三种类型(即序列,图像和信号),这些数据数量巨大且性质复杂。挖掘如此大量的数据用于模式识别是一项巨大的挑战,需要复杂的数据密集型机器学习技术。基于人工神经网络的学习系统以其模式识别能力而闻名,最近它们的深度架构-称为深度学习(DL)-已成功应用于解决许多复杂的模式识别问题。本文调研了DL在识别生物数据模式中的作用,提供了-DL在生物序列,图像和信号数据中的应用;这些数据的开放获取源的概述;适用于这些数据的开源DL工具的描述;并从定性和定量的角度比较这些工具。最后,它概述了挖掘生物数据的一些开放式研究挑战,并提出了一些可能的未来前景。

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丁汉 ,1989 年获华中科技大学工学博士学位。1993 年受德国洪堡基金会资助赴 德国斯图加特大学进行客座研究,1997 年获国家杰出青年基金资助, 2001 年受聘 为上海交通大学长江学者特聘教授, 2005年和2011年两任“973”项目首席科学家, 2013 年当选为中国科学院院士。丁汉教授主要从事机器人与数控加工研究 , 研究成 果在航天、能源和汽车领域得到应用。获国家自然科学二等奖 1 项、国家科技进步二 等奖 2 项 / 三等奖 1 项。
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