小立碗藓调控细胞重新编程的miRNA鉴定及机制研究

项目名称： 小立碗藓调控细胞重新编程的miRNA鉴定及机制研究

项目编号： No.31371243

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 生物科学

项目作者： 王晓琴

作者单位： 北京农学院

项目金额： 80万元

中文摘要： 小立碗藓有基因同源重组率高、高质量全基因组序列、细胞分化能力强等特点，是不可替代的模式植物。细胞重新编程具重要理论和实践意义，但植物细胞重新编程分子调控机制不清。植物原生质体脱分化与动物细胞重新编程本质相同，是理想的研究材料，但其分子调控机制至今没有突破性进展。本项目以小立碗藓原生质体为材料，经高通量测序及数字化分析比较脱分化/细胞重新编程过程中miRNAs表达特征；用生物信息学分析技术预测miRNAs靶基因，用改良5'RACE法验证miRNAs对靶基因切割特性，鉴定预测的靶基因；结合前期转录组和蛋白组数据分析靶基因功能，筛选出两个新的重要miRNAs，用同源重组技术获得性状稳定的转基因株系（目前获得一转基因株系原生质体再生能力明显降低），进而从细胞形态、DNA倍性变化、染色体重塑、DNA甲基化、组蛋白乙酰化、生长素调节等方面剖析miRNAs生物学功能，探索植物细胞重新编程的分子调控机制。

中文关键词： 小立碗藓；原生质体；细胞重新编程；miRNA；调控机制

英文摘要： The Physcomitrella patens is an irreplaceable model plant due to its high rate of homologous recombination, availability of whole genome sequence and strong capacity of cell differentiation, etc. It is important to study on cell reprogramming for its ther

英文关键词： Physcomitrella patens；Protoplast；Cell reprogramming；miRNA；Regulation mechanism