基于ORF水平质量控制的蛋白质基因组学对酵母基因组注释的研究

项目名称： 基于ORF水平质量控制的蛋白质基因组学对酵母基因组注释的研究

项目编号： No.31400698

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 生物科学

项目作者： 高媛

作者单位： 中国人民解放军军事医学科学院

项目金额： 24万元

中文摘要： 测序技术的快速发展为基因组注释和功能基因组学研究提出了更高的要求。而现有的基因组注释依赖的注释软件和核酸序列信息，难于发现物种特异基因或新的基因类群，也难于确定基因边界和翻译调控，导致基因组注释的遗漏或错误。蛋白质是编码基因存在与否的最终判据。蛋白质基因组学不仅可验证已注释基因组，校正原有注释，还可发现遗漏注释基因甚至物种特异的新基因，实现基因组的重注释。然而目前的蛋白质基因组学方法存在假阳性率高，预测基因证据不充分等缺点。本研究以真核模式生物酵母为对象，拟采用基于ORF水平的质量控制策略，正确、高效地鉴定海量质谱数据中存在的新基因编码肽段，结合合成肽段验证、基因转录、结构和调控序列预测以及系统进化等完整的基因验证技术体系，开发自动化高通量的新基因发现和验证流程，提高基因组注释的精度和准度，鉴定一批可验证的酵母新基因或新基因结构，实现酵母基因组的重注释，并为生物学研究提供全新的基因材料。

中文关键词： 基因组注释；蛋白质基因组学；pAnno；酵母；

英文摘要： High-throughput and cost-effective genome sequencing approaches have resulted in the completion of over one thousand genome sequences with the sequencing of thousands of additional species, which laid the foundation to inquiry the genetic blueprint of gen

英文关键词： genome annotation；proteogenomics；pAnno；Saccharomyces cerevisiae；