恶性肿瘤风险lncRNA多态位点识别及其功能注释研究

项目名称： 恶性肿瘤风险lncRNA多态位点识别及其功能注释研究

项目编号： No.31401090

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 生物科学

项目作者： 宁尚伟

作者单位： 哈尔滨医科大学

项目金额： 24万元

中文摘要： lncRNA是一类长度超过200nt的非编码RNA分子，lncRNA上的遗传多态(lncSNPs)可以干扰和破坏lncRNA的功能，引起lncRNA异常表达，进而导致恶性肿瘤的发生。系统识别恶性肿瘤风险lncSNPs并阐明其功能对于探索肿瘤的致病机理具有重要研究意义。本课题将生物信息学分析与生物实验验证相结合，利用恶性肿瘤的二代测序数据、lncRNA芯片数据、SNP数据和功能组学数据等数据资源，开发基于多组学数据融合的恶性肿瘤风险lncSNPs识别算法和特征评价模型，挖掘恶性肿瘤发生发展过程中的风险lncSNPs，研究lncSNPs导致lncRNA功能失调从而引发肿瘤的致病机理，并以结肠癌、胃癌等肿瘤为例，实验验证关键lncSNPs的功能和作用机制，开发恶性肿瘤风险lncSNPs的生物信息学平台。本课题对揭示lncSNPs在肿瘤中的作用机理、开发新的肿瘤标志物和药靶等具有重要的应用价值。

中文关键词： lncRNA多态；数据库；多组学数据；网络；

英文摘要： lncRNAs are a class of non-coding RNA molecules greater than 200 nucleotides in length, human polymorphisms at lncRNAs (lncSNPs) can interfere with lncRNA function and affect their expression, thereby initiating cancers. Systematic identification and func

英文关键词： lncSNPs；database；multi-omics data；network；