项目名称: 蛋白质磷酸化组学数据的生物信息分析
项目编号: No.31171263
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2012
项目学科: 生物科学
项目作者: 薛宇
作者单位: 华中科技大学
项目金额: 60万元
中文摘要: 蛋白质磷酸化是最重要、研究最广泛的共价修饰之一,在各种生物学过程和通路中发挥着不可替代的作用,并可逆的决定了细胞的动力学和可塑性。上游激酶可识别并修饰特定的丝氨酸、苏氨酸或酪氨酸残基,而修饰位点能够被上游磷酸酶识别并去磷酸化,磷酸化位点也可以通过形成"对接位点"从而介导蛋白质-蛋白质相互作用。传统的实验学方法研究磷酸化的分子机制和调控机理需要耗费大量的时间、精力和资金。近几年来,基于高通量质谱学技术的磷酸化组学研究已鉴定了大量的磷酸化位点数据。如何从海量的组学数据中预测并分析有用的信息是本项目的关键科学问题。基于已有的研究基础,申请人拟分别设计预测磷酸化位点上游激酶、磷酸酶及相互作用蛋白质的计算方法,构建整合的蛋白质磷酸化组学数据分析流程和计算平台,系统分析已有的磷酸化组学数据,获得有价值的参考信息,将这些研究策略和方法推广到其他修饰组学的数据分析中,并利用实验学的方法予以部分验证。
中文关键词: 翻译后修饰;磷酸化;去磷酸化;磷酸化结合;泛素化
英文摘要:
英文关键词: Post-translational modification;Phosphorylation;Dephosphorylation;Phospho-binding;Ubiquitination