水稻亚种间新合成四倍体早期世代基因组变异

项目名称： 水稻亚种间新合成四倍体早期世代基因组变异

项目编号： No.31400202

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 生物科学

项目作者： 徐春明

作者单位： 东北师范大学

项目金额： 25万元

中文摘要： 多倍化是植物进化历程中的重要事件，是植物物种形成与进化的重要内在推动力之一，贯穿于整个高等植物进化历史。大量研究结果显示在多倍体物种形成早期会发生大量基因组变异，但是由于早期研究手段的局限性，这些工作对各类基因组变异的发生规律和功能缺乏深入的研究和分析。我们前期的转录组研究结果显示，新合成亚种间四倍体水稻中存在大量部分同源等位基因表达变化的现象，作为转录信息的载体，基因组变异必然在这一过程中起到重要的作用。本研究拟通过采用新一代测序技术对水稻亚种间新合成正反交四倍体早期世代个体进行基因组重测序分析，旨在精确解析多倍化早期的各类基因组变异（序列删除和碱基变异、转座元件激活、部分同源染色体非交互重组）发生的时（发生世代）、空（基因组位置）规律，并在此基础上研究各类型基因组变异对基因表达、功能和表型的影响，进而探讨多倍化诱导产生的快速基因组变异在物种进化和分子育种中的可能作用。

中文关键词： 多倍体；基因组重测序；基因组变异；转座元件；水稻

英文摘要： Polyploidization is a key events that occurred repeatedly throughout the history of plant evolution. It is one of the most important intrinsic driving forces of plant speciation and evolution. Various of genomic changes were revealed in the early generati

英文关键词： polyploid；whole genome sequencing；genomic variation；transposable elements；rice