面向表观遗传学中组蛋白修饰的大间隔机特征选择和识别

项目名称： 面向表观遗传学中组蛋白修饰的大间隔机特征选择和识别

项目编号： No.61363051

项目类型： 地区科学基金项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 自动化技术、计算机技术

项目作者： 杨波

作者单位： 内蒙古大学

项目金额： 43万元

中文摘要： 表观遗传中组蛋白修饰与疾病特别是癌症的防治密切相关。然而,组蛋白及其修饰特征的急剧增加限制了表观遗传及相应疾病的准确识别。结合国民医疗服务发展的迫切需要，本课题旨在研究面向表观遗传学中组蛋白修饰的特征选择和识别，揭示其与疾病间的内在因果关系。首先，将DNA序列转换为分类器能够接收的特征向量。然后，挖掘组蛋白修饰数据的先验知识并引入到大间隔机中作为正则化子，具体的，1）建立基于大间隔判别分析特征选择方法，形成大间隔机的特征选择与抽取的统一框架。2）提出封装结构正则化大间隔机递归特征选择方法。3）提出稀疏结构正则化大间隔机嵌入特征选择方法。4）集成上述特征选择方法。最后，将提出的特征选择方法用于识别组蛋白修饰的水平，并结合机体的形态和功能改变，揭示组蛋白修饰与疾病发生特别是癌症间的内在因果关系。本课题研究能够为疾病特别是癌症的预防和靶向治疗及特异性新药研制提供研究基础和辅助支持。

中文关键词： 组蛋白修饰；特征选择；表观遗传学；大间隔机；识别

英文摘要： The histone modifications in epigenetics is closely related to preventions and therapies of diseases. However, the feature numbers of histone modifications dramatically increase, which limits accurate recognitions of epigenetics and corresponding diseases

英文关键词： Histone Modifications；Feature Selection；Epigenetics；Large Margin Machine；Recognition