蛋白质介导的核酸自组装体系及其计算问题研究与探索

项目名称： 蛋白质介导的核酸自组装体系及其计算问题研究与探索

项目编号： No.61173113

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 计算机科学学科

项目作者： 方刚

作者单位： 西安文理学院

项目金额： 43万元

中文摘要： 近年来，DNA自组装成为纳米材料科学及生物计算等领域研究的热点，它对DNA计算机的发展有着重大的影响。使DNA分子如何按照我们的意愿进行自组装已成为许多学者关注的焦点。DNA进行自组装需要初级的组装元件，这些元件就是经过特意序列设计的核酸片断，然后这些初级元件在特定的环境下形成一维、二维及三维结构。形成这些结构的生化基础就是核酸之间的碱基互补配对，其中序列设计的好坏直接影响着特定结构能否形成。本项目通过往DNA自装配体系中引入与核酸序列有特殊相互作用的蛋白质，将初级元件"粘合"在一起以形成更为复杂的结构，同时探讨这一自组装体系的核酸序列编码。本项目拟研究：1）在某些特殊蛋白质与核酸相互作用基础上的DNA自组装及其序列编码特征。2）基于这一DNA自组装体系的DNA生物计算模型。3）在此基础上给出连通度问题、最大团问题、顶点覆盖问题等图与组合优化问题的DNA生物计算方法并进行生化实验验证。

中文关键词： DNA 自组装；生物计算；蛋白质核酸相互作用；数据库；

英文摘要：

英文关键词： DNA self-assembly；Bio-computing；the interaction between protein and nucleic acid；database；