稻属基因组异染色质区域的进化

项目名称： 稻属基因组异染色质区域的进化

项目编号： No.31171231

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 生物科学

项目作者： 陈明生

作者单位： 中国科学院遗传与发育生物学研究所

项目金额： 80万元

中文摘要： 真核生物的染色体是由细胞学形态迥异的常染色质和异染色质组成。尽管早期研究认为异染色质是基因组中的"垃圾"DNA，但近期研究却发现异染色质具有非常重要的生物学功能，并且蕴含着相当数量的保守基因以及特殊的基因调控途径和表观修饰模式。异染色质的起源与进化一直受到普遍关注，但研究进展相对缓慢。稻属是从事比较基因组学和异染色质进化研究的理想模式系统。前期的细胞学观察表明，水稻第四染色体的短臂存在着大量的异染色质区域，但是在短花药野生稻基因组的同源区域却呈现为常染色质状态，暗示着稻属各物种间可能正经历着染色质环境的动态进化。基于此，我们计划选用稻属十个基因组类型的代表性物种，对其四号染色体短臂上一段2.6Mb的异染色质区域进行比较和进化基因组学分析，以揭示异染色质的进化模式及常染色质/异染色质转换的规律；同时，通过同源基因的表达和表观修饰分析，探讨染色质环境对基因表达调控的影响。

中文关键词： 稻属基因组；异染色质；基因组进化；比较基因组学；

英文摘要：

英文关键词： Oryza genomes；Heterochromatin；Genome Evolution；Comparative Genomics；