Hierarchical Inter-Message Passing for Learning on Molecular Graphs

我们提出了一个在分子图上学习的递阶神经信息传递架构。我们的模型采用了两种互补的图表示:原始的分子图表示和相关的结树,其中节点表示原始图中有意义的簇,如环或桥接化合物。然后,我们通过在每个图中传递消息来学习分子的表示,并使用粗到细和细到粗的信息流在两种表示之间交换消息。我们的方法能够克服经典GNN的一些限制,如检测周期,同时仍然非常有效的训练。我们在ZINC数据集和MoleculeNet基准收集数据集上验证了它的性能。

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